Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col4a3Q9QZS0 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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