Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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