Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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