Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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