Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SrrtQ99MR6 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms