Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ssh3Q8K330 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssh3Q8K330 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms