Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms