Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NipblQ6KCD5 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms