Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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