Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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