Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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