Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DffaO54786 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DffaO54786 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
DffaO54786 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms