Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim18J3QNP2 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms