Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms