Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rtf1A2AQ19 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rtf1A2AQ19 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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