Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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