Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms