Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cln8Q9QUK3 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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