Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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Zbed3Q9D0L1 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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Zbed3Q9D0L1 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Zbed3Q9D0L1 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Zbed3Q9D0L1 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Zbed3Q9D0L1 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms