Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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