Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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