Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprtQ99M80 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprtQ99M80 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprtQ99M80 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprtQ99M80 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
PtprtQ99M80 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprtQ99M80 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms