Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CipcQ8R0W1 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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