Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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Ctdsp2Q8BX07 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ctdsp2Q8BX07 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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