Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Usp38Q8BW70 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms