Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NischQ80TM9 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NischQ80TM9 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NischQ80TM9 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NischQ80TM9 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NischQ80TM9 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NischQ80TM9 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NischQ80TM9 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NischQ80TM9 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NischQ80TM9 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NischQ80TM9 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NischQ80TM9 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms