Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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