Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Pkp4Q68FH0 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Pkp4Q68FH0 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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