Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms