Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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