Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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