Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ctdsp1P58466 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctdsp1P58466 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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