Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprmP28828 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprmP28828 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprmP28828 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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