Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RxraP28700 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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