Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Eftud2O08810 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms