Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms