Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CtcflA2APF3 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CtcflA2APF3 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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