Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit3W8DXL4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit3W8DXL4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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