Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac6Q9Z2V5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms