Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms