Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubl3Q9Z2M6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms