Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms