Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ilf3Q9Z1X4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms