Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms