Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup160Q9Z0W3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup160Q9Z0W3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms