Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms