Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srd5a3Q9WUP4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms