Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms