Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SpdefQ9WTP3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SpdefQ9WTP3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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