Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trpc2Q9R244 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms